Musulmanii ugandezi ocupă multe poziții strategice în securitate, politică, justiție și mass-media, în ciuda faptului că țara are o mare majoritate creștină. Unii creștini ugandezi se tem că valorile creștine sunt subminate în mod sistematic de unii musulmani aflați în funcții de conducere. Creștinii convertiți de la islam se confruntă adesea cu dificultăți din cauza oficialilor musulmani. Ei cer sprijin în rugăciune ca liderii bisericii să răspundă în unitate, cu o strategie înțeleaptă pentru a contracara agenda islamiștilor.